水晶的五大特質——記憶、儲存、擴大、轉換、聚焦。
剛買來的水晶，由於水晶會記憶所有何它接觸過的人事物，因此一塊水晶原石可能保留了採礦工人，礦主，商人，搬運工人，零售商或雕磨師父等等的記憶，也許有些不好的記憶，甚至會影響到水晶擁有者。如果水晶戴久了，或是使用水晶療法，容易吸引負性能量，所以也要做水晶的淨化喔！也有人稱消磁法！可以恢復原來的磁場。一般來講淨化時間約1個月一次就可以了！如果是用來治病的話，每星期就要淨化一次。還有，當水晶摸起來有粘膩感，就記得要趕快淨化了！那現在我們來說說淨化的方法吧！
日光淨化法：利用陽光直接照射，最好在早上到中午前左右的陽光是最適當，約2小時，如果不小心超過時間也沒關係，但是一定要在日落前收回來。（紫晶和粉晶不宜！會褪色）
月光淨化法：聽說最好用滿月時曬比較好（利用日、月之陰陽離子消磁法最好，既可消磁，又可增強水晶能量）。
泡鹽水：要用海鹽，也就是粗鹽，用乾淨無汙染的水去泡一晚，隔天再用乾淨的水衝乾淨，此法對於有金屬或繩子的水晶來說，要少用，因為鹽會侵蝕金屬或繩子喔！乾淨的水可以選用一般的礦泉水或RO逆滲透或蒸餾水都可以。
親近自然法：出遊時，將水晶放在溪水中讓它接近大自然，補充能量。
音樂消磁法：這裡，要強調一下使用自然音樂，不是震耳欲聾、吵死人的搖滾樂，更不是愛來愛去、要死不活的流行音樂哦，而是要如流水、海濤、蟲鳴、鳥叫、或如外層空間的聲波“天籟”，或如古典樂曲中（如巴洛克曲風）的和諧合弦等等，所造成的聲波，持續播放30到60分鐘，也是種方便又有效的消磁方式。在許多的水晶礦石店可發現這類的音樂被整天地播放著，除了可經常性地、持續性地洗滌著每顆寶石，又可營造出一種寧靜、詳和，又有靈性的氣氛，對來挑選購買的顧客，也是種很實惠的滋潤。聲、光、電、熱、磁，都是能源的不同型態，所以以聲音的“振動波”來作消磁的工作，是很自然，也是很正常的啦，不要奇怪。
埋入土中：可以利用乾淨不會有汙水流過的泥土，埋入約3-10天，因為土壤是具有生育的強力能力，而可以奪取毒素，並吹入巨大的能量；如果擔心臟掉，可用植物纖維的布料予以包紮，再埋入土裡。
埋入雪中：這也可以，只要是乾淨的雪，在大自然中的雨、雪、光、溪水等等，都可以讓水晶淨化。
自來水沖洗：就是將水晶礦石放在水龍頭下衝洗個十幾、二十分鐘。可是，這會浪費許多水資源，除非狀況緊急又無其它替代方法時，小編並不建議此種方法。
唸佛淨化：對著水晶誠心誦唸你熟悉的佛經、佛咒，諸如《金剛經》、《大悲咒》、《心經》、《地藏經》、《彌陀經》等等，沒什麼範圍規定，只要是你熟悉的、你覺得好的經咒就可以。連續誦唸49遍最好，如果時間不夠，3、5遍也行。
寺廟過火： 就是到一些供奉、祭拜正神的寺、廟、宮、觀，把水晶在其香爐上”左三圈、右三圈”，轉一轉，就可以了。注意是要拜”正神”的廟噢，不是拜”陰神”，甚至拜”邪神”、”邪靈”的廟噢！
淨香消磁法：就是用檀香、沉香，點一盆在水晶旁，點燃了，藉其香料所燃出來的煙，即可淨化其周遭的能量場。事實上，淨香消磁法可能是所有消磁方法中最方便、最有效力的方法噢！一般在各水晶礦石店，東西又多又大，那動輒數百公斤的礦石如何能輕易搬動去曬太陽、去泡海鹽呢？淨香消磁法就是店家們最常使用的方法。
利用晶簇：放在晶簇、晶洞中，利用品簇、晶洞釋放之正磁場清除水晶的負能量，讓它重新充電，放置時間約一晚左右即可。
天然水晶六角晶柱淨化：六角晶柱他的尖端部份氣場特別強，可以使用四根六角晶柱來作淨化，也屬於很有效的淨化方式之一。首先，將四根六角晶柱的尖端朝內擺，四根分別擺飾方位，分別如東西南北這樣的擺置，中間的位置則放置要淨化的水晶，如此擺置一晚就可以了。
注意：
淨化水晶的過程，雖然海鹽效果奇佳，但正負能量一併消磁，海鹽淨化除必要性外儘量少用。比如用黑曜岩帶右手常用來吸收身體排出的負能量、吸收病氣，則用海鹽淨化比較合適；左手帶黃水晶用來求財，則不該用海鹽淨化。
生病或情緒不佳時，會傳遞不佳的頻率在水晶上，如果可以，最好暫時不戴水晶，當情緒好轉或身體健康時趕快把水晶淨化，免得較多的負能量與身體有過久的共振。
雖然有淨化過，往家裡某個位置一放，就經年累月不管了，常看到水晶上沾滿了灰塵，甚而蜘蛛網，這中間若有過不愉快、吵架，保證頻率會被水晶吸收且放大轉換輸出，本來偶爾吵架，買了水晶之後，變成常吵架，本來是應該善用水晶來改善家庭頻率，水晶卻變成負面的影響力，所以要每一個多月就淨化一次。
家中的臥室應避免擺放水晶，除紫、白、粉三種水晶且儘量是呈水晶球或圓串珠，其餘水晶不宜放在臥室。
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